В FASTPANEL добавить задание в cron можно в разделе "Управление" -> "Планировщик".

В случае использования на сервере панели управления ISPmanager: в меню "Главное" -> "Планировщик".

 

Если Вам нужно запустить скрипт из консоли, используйте команду:

cd /var/www/USER_NAME/data/www/SITE_NAME/; /usr/bin/php -f cron.php

Где USER_NAME - имя владельца сайта

SITE_NAME - имя сайта

cron.php - имя скрипта, который требуется запустить

 

Если нужно выполнять скрипт из браузера:

/usr/bin/wget -O /dev/null "http://site.com/cron.php?start=1"

Где site.com - адрес Вашего сайта

cron.php - имя Вашего скрипта

?start=1 - GET параметр start со значением 1 (если скрипту требуется указывать данные параметры)